Аграрна партія України створена 5 грудня 1996 р. 29 депутатами Верховної Ради, які входили до групи «Аграрники України». Партію зареєстровано Міністерством юстиції 30 грудня того ж року.
В червні 2004 р.на VI (позачерговому) з'їзді партія була перейменована в Народну аграрну партію України, а в лютому 2005 р. - в Народну партію.
7 жовтня 2006 р. відбувся установчий з'їзд, на якому була знову створена Аграрна партія України. Головою партії був обраний народний депутат, президент Української академії аграрних наук Михайло Зубець. 15 листопада того ж року Мінюст зареєстрував Аграрну партію України.
11 вересня 2010 р. відбувся ІІ (позачерговий) з'їзд партії, на якому головою було обрано Віктора Слауту. 31 жовтня 2010 р. партія вперше прийняла участь у виборах до місцевих рад, в ході яких провела до місцевих рад близько 400 депутатів (Полтавська, Запорізька, Тернопільська, Донецька, Херсонська, Харьківсьтка, Черкаська, Житомирська та Вінницька області).
3 липня 2012 р. на другому етапі ІІІ з'їзду Аграрної партії України новим головою партії було обрано Івана Бісюка (заступника міністра аграрної політики та продовольства України - керівника апарату.
Сьогодні в рядах Аграрної партії України налічується 70 тис. членів, об'єднаних у 2600 первинних партійних осередків.
