Родился 19 января 1947 г. в г. Липно (Вроцлавское воеводство, Польша). В 1970 г. окончил факультет внешней торговли Главной школы планирования и статистики в Варшаве (ныне - Варшавская высшая школа экономики), где в 1975 г. защитил докторскую диссертацию. В 1972-1974 гг учился в Университете св. Джонса (Нью-Йорк, США).
В 1969-1981 гг - член правящей Польской объединенной рабочей партии (ПОРП). В 1978-1980 гг Лешек Бальцерович работал в Институте марксизма-ленинизма в Варшаве.
В 1978-1981 гг Лешек Бальцерович возглавлял группу ученых, которые разрабатывали альтернативный проект экономических реформ, член польских Социологического и Экономического обществ, консультант профсоюзного объединения «Солидарность».
В феврале-апреле 1989 г. принял участие в совместном круглом столе ПОРП и оппозиции. Был координатором деятельности Европейской экономической ассоциации в Польше.
12 августа 1989 г., согласившись на предложение президента Леха Валенсы, Лешек Бальцерович занял пост вице-премьера и министра финансов в правительстве Тадеушка Мазовецкого, а также возглавил Экономический комитет при Совете министров. Именно тогда Лешек Бальцерович предложил свой план скорейшего перехода от плановой государственной экономики к рыночным отношениям и верховенства частной собственности. В декабре 1991 г. Лешек Бальцерович ушел из исполнительной власти.
После отставки Лешек Бальцерович работал приглашенным научным сотрудником Университета Брауна (США) и Центра анализа европейской политики в Вашингтоне. В том же году избран профессором Варшавской школы экономики. В качестве советника принимал участие в экономических реформах в России и и других странах Совета экономической взаимопомощи.
В апреле 1994 г. стал соучредителем и председателем центристской партии «Союз свободы», которая в 1997 г. набрала 13% и вошла в правящую коалицию.
31 октября 1997 - 8 июня 2000 г. - заместитель премьер-министра - министр финансов в правительстве Ежи Бузека.
С 10 января 2001 г. по 10 января 2007 г. Лешек Бальцерович возглавлял Национальный банк Польши.
2000-2002 гг - советник президента Грузии Эдуарда Шеварднадзе. С 2003 г. - член Группы авторитетов Международного института финансов.
В октябре 2008 г. Лешек Бальцерович стал одним из восьми членов Европейской экспертной группы по разработке рекомендаций по предотвращению последствий мирового финансового кризиса в странах ЕС.