Родился 22 января 1974 г. в г. Сокаль (Львовская обл.). В 1998 г. окончил юрфак Львовского государственного университета имени И.Франко (сейчас Львовский национальный университет) по специальности «правоведение».
В 1997-1998 гг. Андрей Магера в качестве интерна принимал участие в образовательной программе «Помощник председателя комитета Верховной Рады Украины», совместно организованной аппаратом парламента и Ассоциацией экс-членов Конгресса США. Был избран помощником председателя комитета ВР по вопросам регламента, депутатской этики и обеспечения деятельности депутатов.
После окончания университета Андрей Магера работал учителем английского языка и физвоспитания в Реклинецкой средней школе (Сокальский район Львовской обл.). Одновременно работал помощником-консультантом депутатов ВР.
2000-2001 гг - консультант нардепа Александра Задорожнего, главы парламентского комитета по вопросам правовой политики, а также юрисконсульт в ООО «Вавин Украина» (Киев).
В октябре 2002 г. Андрей Магера возглавил группу помощников нардепа Давида Жвании.
В феврале и декабре 2004 г., а также в июне 2007 г. Андрей Магера избирался членом Центральной избирательной комиссии. С июня 2007 г - замглавы ЦИК.
24 ноября 2004 г. Андрей Магера в числе еще трех из 15 членов ЦИК отказался подписывать протокол с официальными результатами выборов Президента Украины.
С 23 августа 2005 г. - заслуженный юрист Украины.