Кабінет міністрів України пропонує направляти 65% екологічного податку (крім податку, що справляється за утворення радіоактивних відходів (включаючи вже накопичені) та/або тимчасове зберігання радіоактивних відходів їх виробниками понад установлений особливими умовами ліцензії строк) направляти в спеціальний фонд держбюджету. Про це йдеться в змінах до Бюджетного кодексу, що пропонуються проектом закону про внесення змін до Бюджетного кодексу України та деяких інших законодавчих актів України.
На фінансове забезпечення виключно цільових проектів екологічної модернізації підприємств буде спрямовуватись 50% з екологічного податку, що надійшов в держбюджет.
Інші 35% екологічного податку направляється в місцеві бюджети, у тому числі: до сільських, селищних, міських бюджетів - 25%, обласних бюджетів та бюджету Автономної Республіки Крим - 10%, бюджетів міст Києва та Севастополя - 35%;
При цьому у 2011-2013 рр. пропонуються зараховувати до спеціального фонду держбюджету 30%, а до місцевих бюджетів - 70% екологічного податку; у 2013 р. до держбюджету - 53% та 47% до місцевих бюджетів.
В даний момент до спеціального фонду місцевих бюджетів надходить 70% збору за забруднення навколишнього природного середовища.